İşlem aracılığı ve portföy aracılığı arasındaki temel fark, sermaye piyasası araçlarının alım satım işlemlerinde yetki ve sorumluluk dağılımındadır. İşlem aracılığı faaliyetinde, aracı kurum müşteri emirlerini borsa veya borsa dışı platformlarda tamamlar ve bu emirlerin gerçekleştirilmesinden sorumludur. Portföy aracılığı faaliyetinde ise aracı kurum, müşteri emirlerini kendi portföyü üzerinden karşılar ve işlemin karşı tarafı olur.