Prof. Dr. Safi Arpaguş, Marmara Üniversitesi İlahiyat Fakültesi Tasavvuf Anabilim Dalı'nda öğretim üyesi olarak görev yapmaktadır .
Ayrıca, 2547 sayılı Yükseköğretim Kanunu'nun 38. maddesi ve 15 Ekim 2021 tarihli Cumhurbaşkanlığı kararnamesi ile İstanbul İl Müftülüğü görevine atanmıştır .