Ağaç kovukları, enfeksiyon, yanlış bakım ve budamalar, doğal olaylar (fırtına, kar, don) ve hayvan zararları gibi çeşitli nedenlerle oluşur. Bazı oluşum sebepleri: Enfeksiyon: Ağaçlarda açılan yaralar, mantar, zararlı böcek ve bakterilerin nüfuz etmesine yol açar. Yanlış bakım ve budamalar: Özellikle çok dipten yapılan budama, büyük yaralara ve ileride kovuk oluşturacak yaralara sebep olur. Doğal olaylar: Fırtına, kar, don ve yıldırım gibi olaylar, ağaçlarda çatlak ve kırılmalara yol açarak kovuk oluşumuna zemin hazırlar. Hayvan zararları: Kemirgenler, ağaçlara zarar vererek kovukların oluşmasına katkıda bulunabilir.