Askeri hastanelerde çeşitli bölümler bulunmaktadır, bunlar arasında: Genel cerrahi; Ortopedi; İç hastalıkları; Kulak burun boğaz; Göz; Diş; Psikiyatri; Fizik tedavi; Radyoloji; Laboratuvar. Ayrıca, askeri hastaneler tıbbi araştırma merkezleri olarak da hizmet vermektedir.