II. Muaviye, savaşa ve halifeliğin babadan oğula geçmesine karşı olduğu ve şura ile seçilmeyi savunduğu için tahttan indirilmiştir .
684 yılında, Abdullah bin Zübeyr ile olan çatışmaları sonlandırmak amacıyla halifelikten feragat ettiğini açıklamıştır . Bu kararını, bir iç savaşta birçok kişinin hayatını kaybetmesine karşı, kendi hayatını kaybetmeyi tercih ettiğini belirterek gerekçelendirmiştir .
Bazı tarihçiler, II. Muaviye'nin tahttan feragat etmesinin ardından zehirlenerek öldürüldüğünü iddia etmektedir .