Hakan Fidan, çeşitli ülkelerde görev yapmıştır. Bu ülkeler arasında: Almanya: NATO Süratli Reaksiyon Kolordusu Karargahı'nda görev almıştır. Avustralya: Ankara Büyükelçiliği'nde kıdemli siyasi ve ekonomik danışman olarak çalışmıştır. Viyana: Uluslararası Atom Enerjisi Kurumu'nda akademik araştırmalar yürütmüştür. Cenevre: Birleşmiş Milletler Silahsızlanma Enstitüsü'nde görev yapmıştır. Londra: Verification Technologies Research Center'da çalışmıştır. Ayrıca, Fidan'ın Türkiye'de de önemli görevlerde bulunduğu bilinmektedir, bunlar arasında TİKA başkanlığı ve MİT müsteşarlığı yer almaktadır.