Germencik'teki tren kazalarının nedenleri farklılık göstermektedir: 1. 20 Şubat 2020 tarihli kazada, Cemal Bunar idaresindeki otomobilin trafik levhalarına çarpıp takla atarak demir yoluna devrilmesi sonucu tren otomobile çarpmış ve kaza meydana gelmiştir. 2. 3 Şubat 2025 tarihli kazada ise, yolcu treninin ismi öğrenilemeyen bir şahsa çarpması sonucu kaza gerçekleşmiştir. 3. 21 Ağustos 2013 tarihli kazada, demiryolu köprüsünden geçmeye çalışan anne ve çocuklarına trenin çarpması sonucu kaza meydana gelmiştir.