Cem Sultan olayı, Fatih Sultan Mehmet'in vefatından sonra oğulları Bayezid ve Cem arasında başlayan taht mücadelesiyle ortaya çıkmıştır. Olayların özeti: Cem Sultan'a babasının vefat haberinin ulaşmaması için bazı devlet adamları çaba göstermiştir. Cem, haber alamayınca askerleriyle Bursa'ya yönelmiş ve burada kendini padişah ilan etmiştir. İki kardeşin orduları Yenişehir Ovası'nda karşı karşıya gelmiş, savaşı Bayezid kazanmıştır. Yenilginin ardından Cem, Memlükler'e sığınmıştır. Daha sonra Rodos Şövalyeleri'nin davetiyle buraya gitmiş, bu misafirlik esirliğe dönüşmüştür. Avrupa devletleri, Cem Sultan'ı kontrol altında tutarak Osmanlı'dan para almış ve savaş risklerine karşı onu tehdit olarak kullanmıştır. Uzun müzakereler sonucunda Cem'in Papalık'a teslim edilmesine karar verilmiştir. 1495'te Napoli'de hastalanıp vefat etmiş, naaşı uzun süre alıkonulduktan sonra Osmanlı'ya teslim edilmiştir. Sonuçlar: Osmanlı'nın Memlükler ve Avrupa ile olan ilişkileri bozulmuştur. Batıya yapılan fetihler askıya alınmıştır. 2. Bayezid'in dönemi yükseliş yerine duraklama dönemi olmuştur.