Ziya Gökalp Yazma Eser Kütüphanesi'nde gramer, edebiyat, tefsir, hadis, fıkıh, belagat, kelam, akaid, felsefe ve mantık konularını içeren 2200 yazma eser ve 7 bin nadir matbu eser bulunmaktadır. Kütüphanede bulunan bazı önemli eserler: Endülüslü bilgin Said el-Endelüsî’nin 1067 tarihli et-Tarif bi’t-Tabakati’l-Ümem adlı eseri; İbn Sina’nın tıp ilkelerini şiir tarzında yazdığı meşhur Urzucet fi ’t-Tıbb; Kürt edebiyatının önde gelen şahsiyetlerinden Ahmed-i Hani’nin üç eseri. Ayrıca, Ziya Gökalp'in "Türkçülüğün Esasları", "Kızıl Elma", "Türk Medeniyet Tarihi" gibi eserleri de kütüphanede mevcuttur. Kütüphane, ısı ve nem oranı sabit tutulan ve izinle girilen özel bir odada yazma eserleri muhafaza etmektedir.