Zeynep Kamil Kadın ve Çocuk Hastalıkları Eğitim ve Araştırma Hastanesi'nde aşağıdaki bölümler bulunmaktadır: Cerrahi Tıp Birimleri: Anestezi ve Reanimasyon, Çocuk Cerrahisi, Genel Cerrahi, Göz Hastalıkları, Kadın Hastalıkları ve Doğum, Kulak Burun Boğaz Hastalıkları, Üroloji. Dahili Tıp Birimleri: Ağız ve Diş Sağlığı Birimi, Aile Hekimliği, Cildiye, Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları, Diyet, Enfeksiyon Hastalıkları, Fizyoterapi, İç Hastalıkları, Psikiyatri. Temel Tıp Bilimleri: Biyokimya, Genetik Tanı Merkezi, Kan Merkezi, Mikrobiyoloji, Patoloji, Radyoloji. Ayrıca, hastanede Yenidoğan Yoğun Bakım ve Gelişimsel Pediatri gibi özel birimler de mevcuttur.