Neandertaller ve modern insanlar akrabadır, çünkü aralarında genetik melezleşme gerçekleşmiştir. Neandertal geni, günümüzde özellikle Afrika dışında kalan bölgelerde yaşayan modern insanlarda bulunmaktadır. Ancak, Londra Doğa Tarihi Müzesi ve KU Leuven'den araştırmacılar, Neandertaller ve günümüz insanlarının alt türler yerine ayrı türler olarak sınıflandırılması gerektiğini savunmaktadır. Neandertaller ve modern insanlar arasındaki evrimsel ilişki, coğrafi farklılıklar ve farklı çevresel koşullara uyum sağlama süreçleriyle de şekillenmiştir.