Sonderbund Savaşı'nın nedenleri şunlardır: 1. Merkezileşme Karşıtı Hareket: 1830'lu yıllarda İsviçre'de liberallerin iktidara gelmesiyle birlikte, Katolik kantonlarda merkezileşme çabalarına karşı bir tepki oluştu. 2. Manastır Krizi: 1841 yılında Liberaller ile Katolikler arasında yaşanan manastır krizi, gerginliği artırdı ve Katoliklerin Sonderbund İttifakını kurmasına yol açtı. 3. Jesuitlerin Dönüşü: 1845'te Lucerne'nin Cizvitleri eğitimine davet etmesi, kırsal kantonlarda ultramontanizmin bir zaferi olarak görüldü ve silahlı radikallerin kantonu işgal etmesine neden oldu. 4. Federal Anayasanın İhlali: Tagsatzung (Federal Diyet), Sonderbund oluşumunu anayasaya aykırı ilan ederek bu oluşumu zorla ortadan kaldırılmasına karar verdi.