Sıddık Sami Onar, 27 Mayıs 1960 ihtilali sonrasında 147'ler diye bilinen, bazı akademisyenlerin Millî Birlik Komitesi'nce görevden alınmasını protesto etmek için rektörlük görevinden istifa etmiştir .
İstifanın ses getirmesi üzerine 147'ler sorununun çözümünde etkin rol oynayan Onar, üçüncü kez rektör seçilmiş ve 1963 yılına kadar bu görevi sürdürmüştür .