Savantların neden zeki olduğuna dair kesin bir açıklama bulunmamaktadır. Ancak, bu durumun bazı olası nedenleri şunlardır: Beyin hasarı veya yapısal farklılıklar: Savant sendromu, beynin belirli bölgelerinde anormallikler veya hasarlar sonucu ortaya çıkabilir. Hiper sistemize etme: Savantların, empati kurma-sistemize etme teorisinde aşırı bir durum olan "hiper sistemize etme" yeteneğine sahip olduğu öne sürülmüştür. Gelişmiş algı ve duyusal aşırı duyarlılık: Savantların detaylarına gösterilen dikkat, gelişmiş algı veya duyusal aşırı duyarlılığın bir sonucu olabilir. Olağanüstü bellek: Savant sendromunda saptanan özgül becerilere genellikle olağanüstü bir bellek eşlik eder. Ayrıca, bazı araştırmalar savant sendromunun genetik bir yatkınlıkla bağlantılı olabileceğini öne sürmüştür.