Sabancı Üniversitesi'nde ders seçimi şu adımlarla yapılır: 1. Dönem başında kayıt: Öğrenciler, her dönem başında ve akademik takvimde ilan edilen süreler içinde dönem öğrenim ücretini ödedikten sonra danışmanlarının uygun görüşünü alarak ders kayıtlarını yapmak zorundadır. 2. Ders ekleme-bırakma: Ders kayıtları, derslerin başladığı haftayı takip eden ikinci hafta içinde değiştirilebilir (ders ekleme-bırakma süresi). 3. Mazeretli kayıt: Geçerli bir mazereti olan öğrenciler, ders ekleme-bırakma süresi sona erdikten sonra da kayıt yaptırabilir, ancak bu durum enstitü yönetim kurulunun kararına bağlıdır. İsteğe bağlı yaz döneminde ders alacak öğrencilerin de kayıt yaptırması gerekmektedir.