Plütonyum, tüm izotopları radyoaktif ve toksik olduğu için son derece tehlikelidir. Plütonyumun insan sağlığına ve çevreye olan zararları şunlardır: Akciğer kanseri: Plütonyum zerrecikleri havada askıda kalabilir ve solunum yoluyla akciğerlere alındığında akciğer kanserine yol açabilir. Kemik kanseri: Vücuda giren plütonyum kemiklere saldırarak kemik kanserine neden olabilir. Genetik mutasyonlar: Plütonyum, genetik mutasyonlara yol açabilir. Çevre kirliliği: Nükleer reaktörlerdeki plütonyum artıkları ve nükleer denemeler çevreye yayıldığında çevre felaketlerine yol açar. Ayrıca, plütonyum ile çalışırken sağlık sorunları yaşanma olasılığı, solunmadığı veya yutulmadığı sürece düşüktür.