Pilot kalem ile normal kalem arasındaki temel farklar şunlardır: Mürekkep ve uç yapısı: Pilot kalemler, su bazlı mürekkep kullanır ve bu mürekkep daha akışkan olduğu için yazarken yumuşak bir his verir. Kullanım şekli: Pilot kalemlerde mürekkep, uca doğrudan akar, tükenmez kalemlerde ise uçtaki bir bilye sayesinde mürekkep aktarılır. Dayanıklılık ve yazım kalitesi: Pilot kalemler, mürekkep tükenene kadar aynı kalitede yazma avantajı sağlar. Arka sayfaya bulaşma: Pilot kalemler, kağıt yapısına bağlı olarak arka sayfaya mürekkep sızdırabilir. Kullanım kolaylığı: Tükenmez kalemler, kullanım sırasında baskı gerektirmezken, pilot kalemlerin ucunun sürekli hava ile temasının kesilmesi gerekir.