Nemrut Mustafa Paşa, görevini kötüye kullanma ve usulsüzlükler nedeniyle idam edilmiştir. 15 Kasım 1920'de tutuklandıktan sonra yapılan yargılamada, Nusret Bey hakkında çift tutanak tutmaktan suçlu bulunmuş ve 7 ay hapis cezasına çarptırılmıştır. Padişah Vahdettin, sadece 85 gün tutuklu kalan Mustafa Paşa ve arkadaşlarının cezasını, yeterli süre yattıkları gerekçesiyle affetmiştir. Nemrut Mustafa Paşa'nın idam ettiği bazı kişiler şunlardır: Boğazlıyan Kaymakamı Kemal Bey. Eski Urfa Mutasarrıfı Nusret Bey. Karakol Cemiyeti üyesi 16 Kuvayı Milliyeci. Dramalı Rıza Bey.