Mustafa Fazıl Paşa, Osmanlı Sultanı Abdülaziz'in bir fermanı ile Mısır yönetimindeki veraset haklarından mahrum bırakılması nedeniyle sürgün edildi. Ayrıca, Paşa'nın Sadrazam Fuad Paşa ile ters düşmesi ve hükümetin mali konulardaki beceriksizliği üzerine Sultan'a bir tezkere sunması da sürgün kararında etkili oldu.