Mikroskopik inceleme yapmak için aşağıdaki adımlar izlenir: 1. Hazırlık: İncelenecek örnek, lam adı verilen saydam bir aparat üzerine yerleştirilir ve üzeri lamel ile kapatılır, bu işleme preparat denir. Örnek, gerekli durumlarda boyanarak incelenecek kısım belirginleştirilebilir. 2. Mikroskop Ayarları: Mikroskobun ışığı açılır ve diyafram ayarı yapılır; boyasız veya az boyalı preparatlar için diyafram kısık, boyalı veya yoğun preparatlar için diyafram açık olmalıdır. En küçük büyüten objektif ışık yoluna getirilir. 3. Görüntüleme: Preparat, tablaya yerleştirilerek sabitlenir. Şaryo ayar vidaları ile incelenecek bölüm ışık yolu üzerine getirilir. Makro ayar vidası ile görüntü buluncaya kadar tabla hareket ettirilir. Mikro ayar vidası ile görüntü netleştirilir. 4. Farklı Büyütmelerde İnceleme: Daha fazla büyüten bir objektif kullanılacaksa, revolver yardımı ile istenilen objektif ışık yolu üzerine getirilir ve mikro ayar vidası ile görüntü netleştirilir. 5. Sonlandırma: İnceleme bittiğinde makro ayar vidası ile tabla en alt seviyeye indirilir. İmmersiyon objektifi ışık yolundan uzaklaştırılır. Preparat çıkarılarak dezenfektan çözeltisi içerisine atılır. Mikroskop temizlendikten sonra örtülür veya kutusuna yerleştirilir.