2024 LGS sonuçlarının yeniden hesaplanmasının sebebi, Ankara 3. İdare Mahkemesi'nin fen bilimleri dersi A kitapçığındaki 13. soruyu iptal etmesidir. MEB'in açıklamasına göre, bu kararın ardından sınav kılavuzunda yer alan “Sınavlarda iptaline karar verilen sorular değerlendirme dışı bırakılarak geçerli soruların puan değerinin yeniden saptanması suretiyle puanlama yapılır” hükmü gereğince söz konusu soru değerlendirme dışı bırakılarak diğer sorular üzerinden yeniden değerlendirme yapılmıştır. Yeniden puan hesaplanması sonucunda üst tercihlerine yerleşmeye hak kazanan öğrencilere ise yeni kayıt hakkı tanınmıştır.