KYK yurtlarında kurallara uymayan öğrencilere çeşitli cezalar verilir. Bu cezalar şunlardır: 1. Uyarı Cezası: Küçük kural ihlallerinde öğrenciye resmi uyarı verilir. 2. Kınama Cezası: Tekrarlayan kural ihlalleri veya daha ağır disiplin suçları için uygulanır. 3. Yurttan Geçici Çıkarma: Esnek bir süre için öğrencinin yurtta kalma hakkının askıya alınması. 4. Yurttan Süresiz Çıkarma: Ciddi disiplin ihlallerinde öğrencinin yurt kaydının tamamen silinmesi ve KYK yurtlarına tekrar başvurmasının engellenmesi. Ayrıca, yurt malzemesine zarar verme gibi durumlarda da güvence bedeli tahsil edilir ve bu bedeli tamamlamayan öğrencinin yurtla ilişiği kesilir.