Khan Academy'de çok çeşitli konularda dersler bulunmaktadır: Okul dersleri: Okul öncesinden üniversite seviyesine kadar matematik, fen bilimleri ve sosyal bilimler dersleri. Sınava hazırlık dersleri: Okuldaki sınavlar, üniversite giriş sınavları ve üniversitedeki diğer sınavlar için hazırlık materyalleri. İlgi alanlarına göre dersler: Sanat tarihi, finans, bilgisayar bilimi, İngilizce gibi alanlarda dersler. Müze keşifleri: Modern Sanat Müzesi (MoMA) ve Britanya Müzesi gibi müzeler hakkında bilgiler. Ayrıca, platform Pixar in a Box gibi özel kurslar da sunmaktadır.