Başlatma ve bitiş kodonları, protein sentezinde önemli rol oynayan mRNA üzerindeki özel kodon dizileridir. Başlatma kodonu (start codon), çevirinin başladığı yeri işaret eder ve genellikle AUG kodonudur. Bitiş kodonları (stop codons) ise çevirinin bittiği yeri işaret eder ve UAA, UAG ve UGA kodonlarını içerir.