Japon okul sistemi, "6-3-3-4 yıllık sistem" olarak adlandırılır. Bu sistem şu şekilde işler: İlkokul: 6 yıl sürer. Ortaokul: 3 yıl sürer. Lise: 3 yıl sürer. Üniversite: 4 yıl sürer. Zorunlu eğitim, 9 yıldır ve bunun 6 yılı ilkokul, 3 yılı ise ortaokuldur. Okul öncesi eğitim, anaokulları (Yochien) ve gündüz bakımevlerinde (Hoikusho) verilir. Örgün eğitim dışında, yabancı uyruklu çocuklar için yabancı öğrenci okulları ve engelli çocuklar için özel okullar da bulunmaktadır. Eğitim dönemi, ilkbaharda başlar ve yazın 6 hafta tatil yapılır. Okul temizliğinden, öğrenciler sorumludur; ayrıca okulun temizliğini sağlamak amacıyla okula ayakkabı ile girilmesi yasaktır. Atölye çalışmaları yaygındır ve derslerden geçme ile daha iyi bir lise veya üniversiteye gitme garantisi sunar. Üniversiteye giriş, tek bir sınavla yapılır.