İnsanda dört ana çeşit bakteri yaşar: 1. Şekillerine Göre Bakteriler: Yuvarlak (kokus), çubuk, virgül ve spiral bakteriler. 2. Gram Boyanma Özelliğine Göre Bakteriler: Gram (+) pozitif ve Gram (-) negatif bakteriler. 3. Oksijen İhtiyaçlarına Göre Bakteriler: Zorunlu aerobik, zorunlu anaerobik, geçici anaerobik ve geçici aerobik bakteriler. 4. Beslenme Şekillerine Göre Bakteriler: Ototrof ve heterotrof bakteriler.