Hayvan deneylerinde en iyi model hayvan seçimi, araştırmanın amacına ve türüne bağlı olarak değişir. Ancak, fareler ve sıçanlar biyomedikal araştırmalarda en sık kullanılan hayvan modelleridir. Diğer yaygın deney hayvanları arasında tavşan, kobay, hamster, köpek, kedi ve maymun bulunur. Model hayvan seçiminde dikkat edilmesi gereken diğer faktörler arasında hayvanın anatomik, fizyolojik ve davranışsal özellikleri yer alır.