Fen bilimleri, genellikle şu ana dallara ayrılır: Doğa bilimleri: Fizik, kimya, biyoloji (botanik, moleküler biyoloji, mikrobiyoloji, genetik, zooloji, ekoloji), astronomi, yer bilimleri (jeoloji, atmosfer bilimleri, klimatoloji, jeofizik). Fen bilimlerinde teknik ve uygulamalı alanlar: Mühendislik bilimleri (bilgisayar, donanım, yazılım, mekatronik, tarım, havacılık, nükleer enerji), sağlık bilimleri (tıp, veterinerlik, eczacılık). Matematik: Matematiksel mantık, kümeler kuramı, kategori kuramı, cebir, geometri, analiz, topoloji gibi alanlar. Ayrıca, fen bilimleri disiplinlerarası alanlar da içermektedir, örneğin biyolojik psikoloji, biyofizik, biyokimya gibi.