Fen lisesinde idarecilik, Milli Eğitim Bakanlığı'nın belirlediği yönetmeliklere göre yapılır. İdareci seçimi ve atanması şu şekilde gerçekleşir: 1. Öğretmen Seçimi: Fen liselerine öğretmen seçimi, yazılı ve sözlü sınavla yapılır. 2. Yönetici Seçimi: Müdür olarak görevlendirileceklerin, bu okullarda müdür yardımcısı veya öğretmen olarak çalışmış olmaları esastır. 3. Atama: Yöneticiler, valiliklerce, il genelinde her adayın bilgi sahibi olmasını sağlayacak şekilde yapılan duyuru üzerine, hizmet puanı üstünlüğüne göre atanır.