Etken maddeler genel olarak iki ana gruba ayrılır: 1. Primer Metabolitler: Karbonhidratlar, proteinler, lipitler, mineraller ve vitaminler gibi temel bileşikler. 2. Sekonder Metabolitler: Terpenoitler, fenolikler, azotlu bileşikler (alkaloitler) ve diğerleri. Ayrıca, bitkisel etken maddeler arasında uçucu yağlar, glikozitler, saponinler, flavonoidler ve tanenler gibi spesifik gruplar da bulunur.