Endonezya'nın yer şekilleri şunlardır: 1. Volkanik Adalar: Endonezya, volkanik adalardan oluşur ve bu adalarda yaklaşık 150 sönmüş volkan bulunmaktadır. 2. Büyük Adalar: Ülkede Sumatra, Borneo, Cava ve Selebes gibi büyük adalar vardır. 3. İç Denizler: Cava, Sunda, Banda, Flores ve Selebes gibi iç denizler mevcuttur. 4. Dağlık Bölgeler: Özellikle Yeni Gine ve Selebes adalarında dağlık bölgeler bulunur. 5. Bataklıklar ve Ovalar: Doğu sahillerinde geniş bataklık alanları ve düz ovalar yer alır.