Bohr modeli, atomun yapısını açıklamada bazı yetersizliklere sahiptir: 1. Çok elektronlu sistemler: Bohr modeli, yalnızca tek elektronlu sistemler için geçerlidir ve çok elektronlu atomların spektral çizgilerini açıklamada yetersiz kalır. 2. Elektron davranışı: Model, elektronların belirli yörüngelerde hareket ettiğini varsayar, ancak modern kuantum mekaniği, elektronların olasılık dağılımları içinde hareket ettiğini öne sürer. 3. Spektral çizgiler: Bohr modeli, hidrojen atomunun spektral çizgilerini başarılı bir şekilde açıklasa da, diğer elementlerin spektral çizgilerini tam olarak açıklayamaz. 4. Elektron dönüşü: Model, elektron dönüşünü dikkate almaz ve bu, atomların davranışlarını ve etkileşimlerini tam olarak açıklamada sınırlayıcı bir faktördür.