Biruni Üniversitesi'nde aşağıdaki fakültelerde çeşitli bölümler ve programlar bulunmaktadır: 1. Diş Hekimliği Fakültesi: Diş hekimliği alanında eğitim. 2. Eczacılık Fakültesi: Eczacılık bilimi ve uygulamaları. 3. Eğitim Fakültesi: Okul Öncesi Öğretmenliği, İlköğretim Matematik Öğretmenliği, Özel Eğitim Öğretmenliği, Rehberlik ve Psikolojik Danışmanlık, İngilizce Öğretmenliği. 4. Mühendislik ve Doğa Bilimleri Fakültesi: Moleküler Biyoloji ve Genetik, Bilgisayar Mühendisliği, Biyomedikal Mühendisliği. 5. Sağlık Bilimleri Fakültesi: Dil ve Konuşma Terapisi, Beslenme ve Diyetetik, Hemşirelik, Ergoterapi, Fizyoterapi ve Rehabilitasyon, Ebelik, Odyoloji, Çocuk Gelişimi. 6. Tıp Fakültesi: Tıp eğitimi. Ayrıca, Meslek Yüksekokulu ve Lisansüstü Eğitim Enstitüsü de üniversitenin diğer eğitim birimleridir.