Beşiktaşlı Yahya Efendi'nin hikayesi şu şekilde özetlenebilir: Doğum ve İlk Yıllar: 1495 yılında Trabzon'da, Trabzon Kadısı Ömer Efendi ve Afife Hatun'un çocuğu olarak dünyaya gelir. Eğitim: Medrese eğitimini Trabzon'da tamamlar ve daha sonra İstanbul'da Zenbilli Ali Efendi'nin sohbetlerine katılır. Akademik Kariyer: Çeşitli medreselerde müderrislik yapar ve 1553 yılında Sahn-ı Seman Medresesi'nde görev alır. Görevden Azil: Kanuni Sultan Süleyman'ın oğlu Şehzade Mustafa'nın öldürülmesi üzerine padişaha bir mektup yazarak Mahidevran Sultan'a merhamet etmesini ister. İnzivaya Çekilme: Emekli olduktan sonra Beşiktaş'ta bir dergah ve türbe inşa ettirir. Kerametler ve Menkıbeler: Hz. Hızır ile görüştüğü ve çeşitli kerametler gösterdiği rivayet edilir. Ölüm ve Defin: 4 Mayıs 1571'de vefat eder ve Beşiktaş'taki dergahının yanına defnedilir. Beşiktaşlı Yahya Efendi, İstanbullu denizciler tarafından İstanbul Boğazı'nın dört manevi bekçisinden biri olarak kabul edilir.