Atlarda çiftleşme, doğal ve kontrollü olmak üzere iki şekilde gerçekleşir. Doğal çiftleşme sürecinde, aygır ve kısrak içgüdüsel olarak birbirlerine çekilirler. Kontrollü çiftleşme ise bir kişi tarafından denetlenir ve şu yöntemlerle yapılır: - Manuel yöntem: Aygır ve kısrak küçük bir padokta bir araya getirilir. - Biçme yöntemi: Her aygır için 25 kısrak belirlenir ve çiftleşme, vahşi doğadaki gibi gerçekleşir. - Pişirme yöntemi: Aygır, üreme dönemi boyunca birkaç kısrakla birlikte tutulur. - Suni tohumlama: Veteriner, kısrağın rahim ağzına meni enjekte eder. Çiftleşme öncesi, hem aygır hem de kısrak veteriner tarafından muayene edilmelidir.