Kasr-ı Arifan, 718/1318 yılında Şah-ı Nakşibend'in doğduğu köy olarak kurulmuştur. Köyün eski adı Kasr-ı Hinduvan idi, ancak Şah-ı Nakşibend'in büyük şeyhi Muhammed Baba Semmâsî'nin kehanetiyle "arifler köşkü" anlamına gelen Kasr-ı Arifan olarak değiştirilmiştir.