Aerobiyoloji ve palinoloji arasındaki temel fark, araştırma odakları ve inceleme yöntemleridir.

Aerobiyoloji, organizmaların ve biyolojik olarak önemli diğer materyallerin atmosfer yoluyla taşınmasını inceleyen bilim dalıdır 1. Bu bilim dalı, palinoloji, aerosol fiziği, alerji, mikrobiyoloji, biyometroloji, botanik ve entomoloji gibi çeşitli bilim dallarını kapsar 1.

Palinoloji ise, polen ve sporları araştıran bir botanik alt dalıdır 23. Palinoloji, polen morfolojisi, polen fizyolojisi, polen kimyası ve polen analizleri gibi alt dallara ayrılır 2.

Özetle, aerobiyoloji daha geniş bir terim olup, palinoloji bu alanın bir alt dalıdır ve sadece polen ve sporların incelenmesine odaklanır.