Anadolu İmam Hatip Liseleri (AİHL) ile Anadolu Liseleri arasındaki temel fark, AİHL'lerde dini eğitimin daha ağırlıklı olmasıdır. Anadolu Liseleri, öğrencilerin ilgi, yetenek ve başarılarına göre yükseköğretim programlarına hazırlanmalarını amaçlar. Her iki lisede de 9. sınıfta alan seçimi yapılır; ancak AİHL'lerde bu seçim 10. sınıftan itibaren uygulanırken, Anadolu Liselerinde 9. sınıfta tamamlanır. Ayrıca, AİHL'ler sınavlı, sınavsız ve yetenek sınavı ile öğrenci kabul edebilirken, Anadolu Liseleri sınavlı (merkezi sınav sonuçlarına göre) veya sınavsız (yerleşim yeri ve okul başarı puanı esasına göre) öğrenci alır.