Stargate Atlantis'in 3. sezonu, artan üretim maliyetleri nedeniyle iptal edildi. 2008 yılında yaşanan ekonomik kriz, ABD dolarının değer kaybetmesine yol açtı ve bu durum, Kanada'da çekilen dizinin bütçesini olumsuz etkiledi. Dizinin yaratıcıları Brad Wright ve Robert C. Cooper, mali zorluklar nedeniyle yeni bir film veya devam sezonu yerine, diziyi sonlandırmayı tercih ettiler.