Sonic Forces oyununun hikayesi, Sonic the Hedgehog'un Dr. Eggman'in Eggman İmparatorluğu'nun dünyayı ele geçirmesine karşı bir direniş gücüne katılmasını anlatır. Dr. Eggman, Phantom Ruby'nin yardımıyla dünyanın yüzde 99'unu fethetmiştir. Direniş, Eggman'in güçlerine karşı savaşır ancak başarılı olamaz. Bir ay önce, Shadow the Hedgehog, Rouge the Bat'ten Eggman'in komuta zincirinin dışında stratejik olarak önemsiz bir konumda aktif bir üssü olduğunu öğrenir. Oyun, Sonic Mania ile bağlantılı bir hikayeye sahiptir.