The Prodigy'nin en iyi şarkısı konusunda kesin bir görüş yoktur, ancak bazı kaynaklar tarafından öne çıkarılan eserler şunlardır: 1. "Firestarter" (1996) - Bu şarkı, enerjik beat'leri ve Keith Flint'in ayırt edici vokalleriyle elektronik müzik klasiği olarak kabul edilir. 2. "Out of Space" (1992) - Reggae etkilerini içeren bu parça, grubun en sevilen ve zamansız şarkılarından biridir. 3. "Voodoo People" (1994) - Tribal davullar ve elektronik synth'lerin birleşimi, şarkıya benzersiz bir atmosfer kazandırır. 4. "No Good (Start the Dance)" (1994) - Catchy melodisi ve rousing vokalleriyle dans pistlerinin favorisidir. 5. "Breathe" (1996) - Karanlık atmosferi ve güçlü vokalleriyle unutulmaz bir şarkıdır.