Kaptan Amerika'nın en iyi hikayeleri arasında şunlar öne çıkmaktadır: 1. "Man Without a Country" (Captain America #451-453): Mark Waid'in bu hikayesi, Steve Rogers'ın Amerikan vatandaşlığından çıkarılmasıyla yaşadığı krizi ele alır ve vatanseverliğin ne anlama geldiğini sorgulatır. 2. "Captain America: Reborn" (Captain America #605-610): Ed Brubaker'ın bu hikayesi, Rogers'ın ölümden dönüşünü ve Bucky Barnes'ın Kaptan Amerika olarak geçirdiği dönemi işler. 3. "The Winter Soldier" (Captain America Vol. 5 #1-9, 11-14): Ed Brubaker'ın bu eseri, Bucky Barnes'ın Sovyet suikastçısı olarak geri dönüşünü ve Steve Rogers'ın onunla olan mücadelesini anlatır. 4. "Secret Empire" (Captain America #169-175): Bu hikaye, Captain America'nın Watergate skandalına benzer bir şekilde hükümet içindeki yolsuzluğu ortaya çıkarmasını konu alır. 5. "Nomad Arc" (Captain America #180-184): Steve Rogers'ın hayal kırıklığı nedeniyle Kaptan Amerika kimliğini bırakıp Nomad olmasını işler.