Ergene Havzası, Tekirdağ, Kırklareli ve Edirne illerinin büyük bir kısmını kapsamaktadır. Tekirdağ: Çorlu, Çerkezköy, Saray gibi ilçeler havza içinde yer alır. Kırklareli: Lüleburgaz, Babaeski, Vize gibi ilçeler havza sınırları içindedir. Edirne: Merkez, Havsa, İpsala gibi ilçeler havzaya dahildir.