"Fringe" dizisinin en iyi bölümü konusunda farklı görüşler bulunmaktadır, ancak bazı eleştirmenlere göre en iyiler arasında şunlar yer almaktadır: 1. "Peter" (2. sezon, 16. bölüm): Dizinin mitolojisini ve karakter gelişimini mükemmel bir şekilde birleştiren, duygusal ve etkileyici bir bölüm olarak değerlendirilmektedir. 2. "White Tulip" (2. sezon, 18. bölüm): Zaman yolculuğu ve paralel evren temalarını işleyen, izleyiciyi etkileyen bir hikaye sunan bölüm. 3. "Over There (Part 1 & 2)" (2. sezon, 22. ve 23. bölümler): Fringe ekibinin Alternatif Evren'e geçerek Peter'ı kurtarma çabalarını anlatan, heyecan verici bir final serisi. Diğer beğenilen bölümler arasında "Marionette" (3. sezon, 9. bölüm) ve "Liberty" (5. sezon, 12. bölüm) da bulunmaktadır.