Crysis serisi, gelişmiş nanoteknolojik zırhlara sahip askerlerin yer aldığı bir bilim kurgu hikayesine sahiptir. Ana hikaye şu şekilde özetlenebilir: 1. Crysis 1: ABD ordusu, Kuzey Kore'nin işgal ettiği Lingshan Adası'ndaki bir arkeolojik ekibi kurtarmak için Raptor Takımı'nı gönderir. 2. Crysis 2: Hikaye, 2023 yılında New York'ta geçer ve Alcatraz adlı bir ABD denizcisinin, Ceph olarak bilinen uzaylılara karşı verdiği savaşı konu alır. 3. Crysis 3: 2047 yılında geçen oyunda, Prophet karakteri, CELL şirketinin nanodomlarla şehri karantinaya almasından sonra New York'ta intikam peşine düşer. Serinin sonraki oyunları, Ceph ırkının kökeni ve insanlıkla olan çatışması üzerine daha fazla detay ekler.