Büyükada Rum Yetimhanesi, çeşitli nedenlerle terk edilmiştir: 1. Yangın Riski: Binanın tamamen ahşap olması, yangın çıkma riskini yüksek hale getirmiştir. 2. Siyasi Değişimler: Kıbrıs olayları ve İstanbul'daki Rumların sınır dışı edilmesi gibi siyasi değişimler, yetimhanenin faaliyetlerini durdurmuştur. 3. Bakımsızlık: Uzun yıllar boyunca yetimhane bakımsız kalmış ve giderek harap olmuştur. 4. Yasal Kararlar: 1964 yılında Vakıflar Genel Müdürlüğü'nün yetimhaneyi kapatma kararı alması, binanın terk edilmesine yol açmıştır.