Yapılan işlemler ve bildirim yapılan kişiler, Hastane Bilgi Yönetim Sistemi (HBYS) üzerinde belirli bir süre sınırlaması olmaksızın saklanır. HBYS'de verilerin saklanma süresi, ilgili mevzuatta öngörülen veya verilerin işlendiği amaç için gerekli olan süre kadar muhafaza edilir .
Örneğin, kişisel verilerin silinmesi, yok edilmesi veya anonim hale getirilmesi, ilgili kişinin talebi üzerine veya kanuni saklama koşulları altında gerçekleştirilir . Ayrıca, verilerin yedeklenmesi ve offline ortamlarda süresiz olarak saklanması da yaygın bir uygulamadır .