Yandex Browser, çeşitli güvenlik özellikleri sunsa da, bazı gizlilik endişeleri barındırmaktadır. Güvenlik özellikleri: Güvenli olmayan ağlarda DNS sızdırma koruması; DNSCrypt ve otomatik HTTPS desteği. Gizlilik endişeleri: Yandex'in arama sorgularını toplayıp analiz için sunucusuna göndermesi; Kapalı kaynak kodlu olması, bu nedenle kullanıcıların arka planda ne olduğunu görememesi; Rus hükümetine bağlı olduğu iddiaları. Yandex'in güvenilirliği, kullanım amacına ve kişisel güvenlik ile gizlilik tercihlerine bağlı olarak değişebilir.