Threads hesabını silmek için Instagram hesabı da silinmelidir. Threads hesabı, uygulama içerisinden silinemez. Instagram hesabı silme adımları: iOS kullanıcıları "Ayarlar" kısmından "Hesap Sil" seçeneğini kullanarak hesabı silebilir. Android kullanıcılar ilgili linke gidip, kullanıcı adı ve şifre bilgilerini girerek hesabı silebilir. Son aşamada, hesabı silme nedeni belirtilip "Hesap Sil" butonuna tıklanmalıdır. Threads hesabı, devre dışı bırakılarak dondurulabilir.