MSI anakart BIOS ayarlarına girmek için genellikle F2 veya Delete tuşlarına basılır. BIOS ayarlarında yapılabilecek bazı işlemler: EZ Modu: Temel sistem bilgilerine ve sık kullanılan ayarlara erişim sağlar. Gelişmiş Mod: Donanım ayarlarını ve sistem parametrelerini ayrıntılı olarak yapılandırma imkanı sunar. Hız Aşırtma (Overclock): Manüel veya otomatik olarak RAM ve CPU hız aşırtma yapılabilir. BIOS Güncelleme: M-Flash yardımcı programı ile BIOS güncellenebilir. Donanım İzleme: Fan hızı, sistem sıcaklığı ve voltaj gibi değerler izlenebilir. BIOS ayarlarında yapılan değişiklikler, bilgisayarın işlemci ve RAM ayarlarını bozabilir ve ekstra maliyetlere yol açabilir. Bu nedenle, deneyimsiz kullanıcıların dikkatli olması önerilir.